The evolution of repetitive DNA and its methylation (C09*)

• Subject Area: General Genetics and Functional Genome Biology
• Term: from 2014 to 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 13532522

Alu Retrotransposons sind parasitäre DNA Elemente, die sich durch reverse Transkription ihrer RNA-Produkte vermehren und schnell evolvieren. Wir werden die evolutionäre Fitness verschiedener Alu Sequenzvarianten anhand ihrer Genom-Reintegrationsraten messen. Durch die Kombination phylogenetischer Daten mit DNA Methylierungs-, Transkriptom- und Chromatin-Immunopräzipitationsdaten werden wir den Einfluss von Alu-Sequenzvariationen auf Determinanten ihrer evolutionären Fitness wie z.B. Alu-Transkription, Stabilität von Alu-Transkripten und deren Reintegrationspotential quantifizieren.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 680: Molecular Basis of Evolutionary Innovations
• Applicant Institution: Universität zu Köln
• Project Head: Professor Dr. Achim Tresch