Kombinatorische Regulation von Genexpressionsphasen

• Antragsteller: Professor Dr. Michael Brunner; Professor Dr. Hanspeter Herzel
• Fachliche Zuordnung: Elektronische Halbleiter, Bauelemente und Schaltungen, Integrierte Systeme, Sensorik, Theoretische Elektrotechnik ; Biochemie ; Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2016
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 251407455

Eukaryotische Gene werden in der Regel durch mehrere Transkriptionsfaktoren in kombinatorischer Weise reguliert. Insbesondere für rhythmische Expressionsmuster, die durch transkriptionelle Rückkopplungen generiert werden, ist ein quantitatives Verständnis essenziell, da die Expressionsphasen die physiologischen Funktionen bestimmen.Wir kombinieren in unserem Projekt bioinformatische Promoteranalysen, Hochdurchsatzdaten (Expressionsprofile und ChIP-Seq) und kinetische Modellierung. Auf diese Waise soll der Informationstransfer von aktivierenden und inhibierenden Regulatoren zu den Genexpressionsphasen analysiert werden. Eine vergleichende Analyse der zirkadianen Rhythmen von Säugern und einer Pilzart ermöglicht es, generelle Mechanismen zu studieren wie die Amplitudenverstärkung durch gemeinsame Bindestellen ('OR funnel') oder die Erzeugung von Harmonischen bei unabhängiger Regulation ('AND funnel').

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 1395: Informations- und Kommunikationstheorie in der Molekularbiologie (InKoMBio)