Nano-HPLC gekoppeltes Massenspektrometer

• Subject Area: Plant Sciences
• Term: Funded in 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 245759763

Das beantragte nano-LC ESI-Massenspektrometer stellt eine Neuanschaffung dar. Das am Standort für die Peptidanalyse zur Verfügung stehende Gerät ist ausgelastet und genügt bezüglich Scanraten, Sensitivität und Massenauflösung bei weitem nicht unseren Anforderungen. Wir verfolgen mit dem beantragten Instrument folgende Ziele: Analysen von Änderungen im Proteom nach Perturbationen durch veränderte Umweltbedingungen, Wirkstoff-Applikation, oder den Verlust einer Genfunktion in eukaryotischen Modellorganismen. Wir wenden hierfür Markierungen mit stabilen Isotopen (15N, SILAC) und Massenspektrometrie im Shotgun-Verfahren an. Die hohe Komplexität der Proben, vor allem aus Zeitreihen-Experimenten, erfordert hohe Scanraten bei gleichzeitig hoher Massenauflösung und Sensitivität. Analyse von Protein-Protein-Interaktionen basierend auf stabilen Isotopen und Immunopräzipitation, sowie Analyse von Dipeptiden aus Crosslink-Ansätzen. Hierfür werden qualitativ hochwertige Fragmentspektren mit hoher Massengenauigkeit benötigt. Analyse von Subproteomen. Analyse von Phosphoproteomen. Analyse von Lipiden für Lipidomics- Ansätze.Das Instrument ist ein zentrales Element für einen neuen systembiologischen Schwerpunkt an der TU Kaiserslautern.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: Nano-HPLC gekoppeltes Massenspektrometer
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
• Leader: Professor Dr. Michael Schroda