GSC 97: Internationale Graduiertenschule für Biomedizin und Bioengineering Dresden
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die 2006 gegründete Dresden International Graduate School for Biomedicine and Bioengineering (DIGS-BB) umfasst derzeit 112 Doktoranden und 72 Forschungsgruppen. Gemeinsam mit ihrem Partner Programm, der International Max Planck Research School for Cell, Developmental and Systems Biology (IMPRS-CellDevoSys), stellt es eines der größten internationalen PhD-Programme im Bereich der Lebenswissenschaften in Deutschland dar. Als innovative fakultätenübergreifenden Einrichtung der TU Dresden hat sich die DIGS-BB zu einem Modell für das universitäre Promotions-System entwickelt. Rund 700 Nachwuchswissenschaftler aus aller Welt bewerben sich jährlich um die Zulassung zu einem der sechs hochvernetzten wissenschaftlichen Forschungsprogramme “Cell, Molecular and Developmental Biology”, “Biomedicine”, “Regenerative and Degenerative Biology”, “Bioengineering and Biomaterials”, “Biophysics” und “Computational Biology”. Als integraler Bestandteil der Dresdner Exzellenzforschung leistet das DIGS-BB durch die Ausbildung und Unterstützung des ausgewählten wissenschaftlichen Nachwuchses einen essentiellen Beitrag zu den hohen Standards und der außergewöhnlichen Dynamik des Exzellenzbereichs „Lebenswissenschaften“ an der TU Dresden. Die Qualität der DIGS-BB Doktoranden/-innen wird durch den hochkompetitiven Auswahlprozess der Bewerber/innen, ein individuell auf jeden Doktoranden zugeschnittenes Betreuungskonzept, eine Unterstützungsstruktur in Form neuester Technologien einschließlich der entsprechenden Experten/-innen und ein an die interdisziplinäre Ausrichtung der Forschungsprojekte angepasstes Ausbildungskonzept sichergestellt. Dank der Unterstützung bei der Gewinnung und Betreuung exzellenter Doktoranden/-innen sowie der Verankerung und Integration in die starke interdisziplinäre Gemeinschaft der Lebenswissenschaften in Dresden ist die DIGS-BB auch eine herausragende Einrichtung für die Karriereentwicklung von Nachwuchsgruppenleitern/-innen und Postdocs. In der zweiten Förderperiode erweiterte die DIGS-BB die Förder- und Betreuungsaspekte auf die Postdoc-Phase sowie durch Forschungspraktika auf BSc- und Master-Studierende. Außerdem profitierten die Doktoranden/-innen von den vielfältigen Möglichkeiten, ihre Forschungsergebnisse zu präsentieren und während der Promotion eine Karriereberatung zu erhalten. Mit dem Status "Young Investigator" wurde der leistungsstarken Gruppe der Nachwuchsgruppenleiter/innen die Möglichkeit eröffnet, Doktoranden/-innen zu betreuuen, in Promotionsverfahren zu prüfen und Gutachten zu schreiben sowie in die Fakultäten integriert zu werden. Durch die Fortführung des mit der Gründung im Jahr 2006 begonnenen erfolgreichen Weges und die kontinuierliche Maßnahmenoptimierung hat sich die DIGS-BB als ein führendes, international anerkanntes Graduiertenzentren etabliert.
Link zum Abschlussbericht
https://doi.org/10.2314/KXP:1699289700
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- Acute inflammation initiates the regenerative response in the adult zebrafish brain. Science. 2012 Dec 7;338(6112):1353-6
Kyritsis N, Kizil C, Zocher S, Kroehne V, Kaslin J, Freudenreich D, Iltzsche A, Brand M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.1228773) - Combined RNAi and localization for functionally dissecting long noncoding RNAs. Nat Methods. 2012 Feb 12;9(4):360-2
Chakraborty D, Kappei D, Theis M, Nitzsche A, Ding L, Paszkowski-Rogacz M, Surendranath V, Berger N, Schulz H, Saar K, Hubner N, Buchholz F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.1894) - Elastic volume reconstruction from series of ultra-thin microscopy sections. Nat Methods. 2012 Jun 10;9(7):717-20
Saalfeld S, Fetter R, Cardona A, Tomancak P
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2072) - Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):676-82
Schindelin J, Arganda-Carreras I, Frise E, Kaynig V, Longair M, Pietzsch T, Preibisch S, Rueden C, Saalfeld S, Schmid B, Tinevez JY, White DJ, Hartenstein V, Eliceiri K, Tomancak P, Cardona A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2019) - Forces driving epithelial spreading in zebrafish gastrulation. Science. 2012 Oct 12;338(6104):257- 60
Behrndt M, Salbreux G, Campinho P, Hauschild R, Oswald F, Roensch J, Grill SW, Heisenberg CP
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.1224143) - Meiotic prophase requires proteolysis of M phase regulators mediated by the meiosis-specific APC/CAma1. Cell. 2012 Oct 26;151(3):603-18
Okaz E, Argüello-Miranda O, Bogdanova A, Vinod PK, Lipp JJ, Markova Z, Zagoriy I, Novak B, Zachariae W
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2012.08.044) - Omnidirectional microscopy. Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):656-7
Weber M, Huisken J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2022) - Synthetic Bio-nanoreactor: Mechanical and Chemical Control of Polymersome Membrane Permeability. Angew Chem Int Ed Engl. 2012 Apr 27;51(18):4448-51
Gaitzsch J, Appelhans D, Wang L, Battaglia G, Voit B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201108814) - A genomic toolkit to investigate kinesin and myosin motor function in cells. Nat Cell Biol. 2013 Mar;15(3):325-34
Maliga Z, Junqueira M, Toyoda Y, Ettinger A, Mora-Bermúdez F, Klemm RW, Vasilj A, Guhr E, Ibarlucea-Benitez I, Poser I, Bonifacio E, Huttner WB, Shevchenko A, Hyman AA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncb2689) - ATR acts stage specifically to regulate multiple aspects of mammalian meiotic silencing. Genes Dev. 2013 Jul 1;27(13):1484-94
Royo H, Prosser H, Ruzankina Y, Mahadevaiah SK, Cloutier JM, Baumann M, Fukuda T, Höög C, Tóth A, de Rooij DG, Bradley A, Brown EJ, Turner JM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gad.219477.113) - Defined Polymer-Peptide Conjugates to Form Cell-Instructive starPEG-Heparin Matrices In Situ. Adv Mater. 2013 May 14;25(18):2606-10
Tsurkan MV, Chwalek K, Prokoph S, Zieris A, Levental KR, Freudenberg U, Werner C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/adma.201300691) - Dynamic Guiding of Motor-Driven Microtubules on Electrically Heated, Smart Polymer Tracks. Nano Lett. 2013 Jun 10
Schroeder V, Korten T, Linke H, Diez S, Maximov I
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/nl402004s) - Dynein motion switches from diffusive to directed upon cortical anchoring. Cell. 2013 Jun 20;153(7):1526-36
Ananthanarayanan V, Schattat M, Vogel SK, Krull A, Pavin N, Tolić-Nørrelykke IM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2013.05.020) - Image-based analysis of lipid nanoparticle-mediated siRNA delivery, intracellular trafficking and endosomal escape. Nat Biotechnol. 2013 Jul;31(7):638-46
Gilleron J, Querbes W, Zeigerer A, Borodovsky A, Marsico G, Schubert U, Manygoats K, Seifert S, Andree C, Stöter M, Epstein-Barash H, Zhang L, Koteliansky V, Fitzgerald K, Fava E, Bickle M, Kalaidzidis Y, Akinc A, Maier M, Zerial M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nbt.2612) - Integration of chemical and RNAi multiparametric profiles identifies triggers of intracellular mycobacterial killing. Cell Host Microbe. 2013 Feb 13;13(2):129-42
Sundaramurthy V, Barsacchi R, Samusik N, Marsico G, Gilleron J, Kalaidzidis I, Meyenhofer F, Bickle M, Kalaidzidis Y, Zerial M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.chom.2013.01.008) - Lypd6 enhances Wnt/β-catenin signaling by promoting Lrp6 phosphorylation in raft plasma membrane domains. Dev Cell. 2013 Aug 26;26(4):331-45
Özhan G, Sezgin E, Wehner D, Pfister AS, Kühl SJ, Kagermeier-Schenk B, Kühl M, Schwille P, Weidinger G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.devcel.2013.07.020) - Lypd6 enhances Wnt/β-catenin signaling by promoting Lrp6 phosphorylation in raft plasma membrane domains. Dev Cell. 2013 Aug 26;26(4):331-45
Özhan G, Sezgin E, Wehner D, Pfister AS, Kühl SJ, Kagermeier-Schenk B, Kühl M, Schwille P, Weidinger G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.devcel.2013.07.020) - Neuroinflammation and central nervous system regeneration in vertebrates. Trends Cell Biol. 2013 Sep 9. Review. doi:pii: S0962-8924(13)00137-2
Kyritsis N, Kizil C, Brand M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.tcb.2013.08.004) - OpenSPIM: an open-access light-sheet microscopy platform. Nat Methods. 2013 Jul;10(7):598-9
Pitrone PG, Schindelin J, Stuyvenberg L, Preibisch S, Weber M, Eliceiri KW, Huisken J, Tomancak P
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2507) - Pivoting of microtubules around the spindle pole accelerates kinetochore capture. Nat Cell Biol. 2013 Jan;15(1):82-7
Kalinina I, Nandi A, Delivani P, Chacón MR, Klemm AH, Ramunno-Johnson D, Krull A, Lindner B, Pavin N, Tolić-Nørrelykke IM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncb2640) - Progenitor networking in the fetal primate neocortex. Neuron. 2013 Oct 16;80(2):259-62
Huttner WB, Kelava I, Lewitus E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.neuron.2013.10.004) - Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators. Genome Res. 2013 Oct 22
Scheibe M, Arnoult N, Kappei D, Buchholz F, Decottignies A, Butter F, Mann M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gr.151878.112) - Reactivating head regrowth in a regeneration-deficient planarian species. Nature. 2013 Aug 1;500(7460):81-4
Liu SY, Selck C, Friedrich B, Lutz R, Vila-Farré M, Dahl A, Brandl H, Lakshmanaperumal N, Henry I, Rink JC
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature12414) - Secretion and signaling activities of lipoprotein-associated hedgehog and non-sterol-modified hedgehog in flies and mammals. PLoS Biol. 2013 Mar;11(3):e1001505
Palm W, Swierczynska MM, Kumari V, Ehrhart-Bornstein M, Bornstein SR, Eaton S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001505) - The helicase-like domains of type III restriction enzymes trigger long-range diffusion along DNA. Science. 2013 Apr 19;340(6130):353-6
Schwarz FW, Tóth J, van Aelst K, Cui G, Clausing S, Szczelkun MD, Seidel R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.1231122) - Tightly anchored tissue-mimetic matrices as instructive stem cell microenvironments. Nat Methods. 2013 Aug;10(8):788-9
Prewitz MC, Seib FP, von Bonin M, Friedrichs J, Stißel A, Niehage C, Müller K, Anastassiadis K, Waskow C, Hoflack B, Bornhäuser M, Werner C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2523) - A wax ester promotes collective host finding in the nematode Pristionchus pacificus. Nat Chem Biol. 2014 Apr;10(4):281-5
Penkov S, Ogawa A, Schmidt U, Tate D, Zagoriy V, Boland S, Gruner M, Vorkel D, Verbavatz JM, Sommer RJ, Knölker HJ, Kurzchalia TV
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nchembio.1460) - An adaptive threshold in mammalian neocortical evolution. PLoS Biol. 2014 Nov 18;12(11):e1002000
Lewitus E, Kelava I, Kalinka AT, Tomancak P, Huttner WB
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1002000) - Dual role of B7 costimulation in obesity-related nonalcoholic steatohepatitis and metabolic dysregulation. Hepatology. 2014 Oct;60(4):1196-210
Chatzigeorgiou A, Chung KJ, Garcia-Martin R, Alexaki VI, Klotzsche-von Ameln A, Phieler J, Sprott D, Kanczkowski W, Tzanavari T, Bdeir M, Bergmann S, Cartellieri M, Bachmann M, Nikolakopoulou P, Androutsellis-Theotokis A, Siegert G, Bornstein SR, Muders MH, Boon L, Karalis KP, Lutgens E, Chavakis T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/hep.27233) - Fusion of protein aggregates facilitates asymmetric damage segregation. PLoS Biol. 2014 Jun 17;12(6):e1001886
Coelho M, Lade SJ, Alberti S, Gross T, Tolić IM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001886) - Genome-wide RNA Tomography in the zebrafish embryo.Cell. 2014 Oct 23;159(3):662-75
Junker JP, Noël ES, Guryev V, Peterson KA, Shah G, Huisken J, McMahon AP, Berezikov E, Bakkers J, van Oudenaarden A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.09.038) - High-resolution reconstruction of the beating zebrafish heart. Nat Methods. 2014 Sep;11(9):919-22
Mickoleit M, Schmid B, Weber M, Fahrbach FO, Hombach S, Reischauer S, Huisken J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.3037) - Kit regulates HSC engraftment across the human-mouse species barrier. Cell. 2014 Aug 7;15(2):227-38
Cosgun KN, Rahmig S, Mende N, Reinke S, Hauber I, Schäfer C, Petzold A, Weisbach H, Heidkamp G, Purbojo A, Cesnjevar R, Platz A, Bornhäuser M, Schmitz M, Dudziak D, Hauber J, Kirberg J, Waskow C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.stem.2014.06.001) - Microinjection of membrane-impermeable molecules into single neural stem cells in brain tissue. Nat Protoc. 2014 May;9(5):1170-82
Wong FK, Haffner C, Huttner WB, Taverna E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nprot.2014.074) - Production of systemically circulating Hedgehog by the intestine couples nutrition to growth and development. Genes Dev. 2014 Dec 1;28(23):2636-51
Rodenfels J, Lavrynenko O, Ayciriex S, Sampaio JL, Carvalho M, Shevchenko A, Eaton S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gad.249763.114) - Shape-controlled synthesis of gold nanostructures using DNA origami molds. Nano Lett. 2014 Nov 12;14(11):6693-8
Helmi S, Ziegler C, Kauert DJ, Seidel R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/nl503441v) - Small-molecule RORγt antagonists inhibit T helper 17 cell transcriptional network by divergent mechanisms. Immunity. 2014 Apr 17;40(4):477- 89
Xiao S, Yosef N, Yang J, Wang Y, Zhou L, Zhu C, Wu C, Baloglu E, Schmidt D, Ramesh R, Lobera M, Sundrud MS, Tsai PY, Xiang Z, Wang J, Xu Y, Lin X, Kretschmer K, Rahl PB, Young RA, Zhong Z, Hafler DA, Regev A, Ghosh S, Marson A, Kuchroo VK
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.immuni.2014.04.004) - The Coilin Interactome Identifies Hundreds of Small Noncoding RNAs that Traffic through Cajal Bodies. Mol Cell. 2014 Nov 6;56(3):389-99
Machyna M, Kehr S, Straube K, Kappei D, Buchholz F, Butter F, Ule J, Hertel J, Stadler PF, Neugebauer KM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.10.004) - Tissue-engineered 3D tumor angiogenesis models: Potential technologies for anti-cancer drug discovery. Adv Drug Deliv Rev. 2014 Dec 15;79-80C:30-39
Chwalek K, Bray LJ, Werner C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.addr.2014.05.006) - Using pancreas tissue slices for in situ studies of islet of Langerhans and acinar cell biology. Nat Protoc. 2014 Dec;9(12):2809-22
Marciniak A, Cohrs CM, Tsata V, Chouinard JA, Selck C, Stertmann J, Reichelt S, Rose T, Ehehalt F, Weitz J, Solimena M, Slak Rupnik M, Speier S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nprot.2014.195) - A Human Interactome in Three Quantitative Dimensions Organized by Stoichiometries and Abundances. Cell. 2015 Oct 22;163(3):712-23
Hein MY, Hubner NC, Poser I, Cox J, Nagaraj N, Toyoda Y, Gak IA, Weisswange I, Mansfeld J, Buchholz F, Hyman AA, Mann M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.09.053) - A Liquid-to-Solid Phase Transition of the ALS Protein FUS Accelerated by Disease Mutation. Cell. 2015 Aug 27;162(5):1066-77
Patel A, Lee HO, Jawerth L, Maharana S, Jahnel M, Hein MY, Stoynov S, Mahamid J, Saha S, Franzmann TM, Pozniakovski A, Poser I, Maghelli N, Royer LA, Weigert M, Myers EW, Grill S, Drechsel D, Hyman AA, Alberti S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.07.047) - A Single-Strand Annealing Protein Clamps DNA to Detect and Secure Homology. PLoS Biol. 2015 Aug 13;13(8):e1002213
Ander M, Subramaniam S, Fahmy K, Stewart AF, Schäffer E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1002213) - Diffusible crosslinkers generate directed forces in microtubule networks. Cell. 2015 Mar 12;160(6):1159-68
Lansky Z, Braun M, Lüdecke A, Schlierf M, ten Wolde PR, Janson ME, Diez S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.01.051) - Effects of high-dose oral insulin on immune responses in children at high risk for type 1 diabetes: the Pre-POINT randomized clinical trial. JAMA. 2015 Apr 21;313(15):1541-9
Bonifacio E, Ziegler AG, Klingensmith G, Schober E, Bingley PJ, Rottenkolber M, Theil A, Eugster A, Puff R, Peplow C, Buettner F, Lange K, Hasford J, Achenbach P; Pre-POINT Study Group
(Siehe online unter https://doi.org/10.1001/jama.2015.2928) - Engineering Functional Polymer Capsules toward Smart Nanoreactors. Chem Rev. 2015 Aug 31
Gaitzsch J, Huang X, Voit B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.5b00241) - Long non-coding RNAs in corticogenesis: deciphering the non-coding code of the brain. EMBO J. 2015 Oct 29
Aprea J, Calegari F
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201592655) - Quantifying the density and utilization of active sites in non-precious metal oxygen electroreduction catalysts. at Commun. 2015 Oct 21;6:8618
Sahraie NR, Kramm UI, Steinberg J, Zhang Y, Thomas A, Reier T, Paraknowitsch JP, Strasser P
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms9618) - C14ORF39/SIX6OS1 is a constituent of the synaptonemal complex and is essential for mouse fertility. Nat Commun. 2016 Oct 31;7:13298
Gómez-H L, Felipe-Medina N, Sánchez-Martín M, Davies OR, Ramos I, García-Tuñón I, de Rooij DG, Dereli I, Tóth A, Barbero JL, Benavente R, Llano E, Pendas AM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms13298) - Corrigendum: Noncovalent Hydrogel Beads as Microcarriers for Cell Culture. Angew Chem Int Ed Engl. 2016 Aug 26;55(36):10549
Wieduwild R, Krishnan S, Chwalek K, Boden A, Nowak M, Drechsel D, Werner C, Zhang Y
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201607037) - Directed evolution of a recombinase that excises the provirus of most HIV-1 primary isolates with high specificity. Nat Biotechnol. 2016 Apr;34(4):401-9
Karpinski J, Hauber I, Chemnitz J, Schäfer C, Paszkowski-Rogacz M, Chakraborty D, Beschorner N, Hofmann-Sieber H, Lange UC, Grundhoff A, Hackmann K, Schrock E, Abi-Ghanem J, Pisabarro MT, Surendranath V, Schambach A, Lindner C, van Lunzen J, Hauber J, Buchholz F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nbt.3467) - FGF8 and SHH substitute for anterior-posterior tissue interactions to induce limb regeneration. Nature. 2016 May 19;533(7603):407-10
Nacu E, Gromberg E, Oliveira CR, Drechsel D, Tanaka EM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature17972) - Identification of proliferative and mature β-cells in the islets of Langerhans. Nature. 2016 Jul 21;535(7612):430-4
Bader E, Migliorini A, Gegg M, Moruzzi N, Gerdes J, Roscioni SS, Bakhti M, Brandl E, Irmler M, Beckers J, Aichler M, Feuchtinger A, Leitzinger C, Zischka H, Wang-Sattler R, Jastroch M, Tschöp M, Machicao F, Staiger H, Häring HU, Chmelova H, Chouinard JA, Oskolkov N, Korsgren O, Speier S, Lickert H
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature18624) - Inactivation of Cancer Mutations Utilizing CRISPR/Cas9. Natl Cancer Inst. 2016 Aug 30;109(1). pii: djw183
Gebler C, Lohoff T, Paszkowski-Rogacz M, Mircetic J, Chakraborty D, Camgoz A, Hamann MV, Theis M, Thiede C, Buchholz F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/jnci/djw183) - Meiotic DNA break formation requires the unsynapsed chromosome axis-binding protein IHO1 (CCDC36) in mice. Nat Cell Biol. 2016 Nov;18(11):1208- 1220
Stanzione M, Baumann M, Papanikos F, Dereli I, Lange J, Ramlal A, Tränkner D, Shibuya H, de Massy B, Watanabe Y, Jasin M, Keeney S, Tóth A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncb3417) - Microtubule doublets are double-track railways for intraflagellar transport trains. Science. 2016 May 6;352(6286):721-4
Stepanek L, Pigino G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.a af4594) - Retinal transplantation of photoreceptors results in donor-host cytoplasmic exchange. Nat Commun. 2016 Oct 4;7:13028
Santos-Ferreira T, Llonch S, Borsch O, Postel K, Haas J, Ader M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms13028) - Simultaneous Single-Molecule Force and Fluorescence Sampling of DNA Nanostructure Conformations Using Magnetic Tweezers. Nano Lett. 2016 Jan 13;16(1):381-6
Kemmerich FE, Swoboda M, Kauert DJ, Grieb MS, Hahn S, Schwarz FW, Seidel R, Schlierf M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.5b03956) - The bulk of the hematopoietic stem cell population is dispensable for murine steady-state and stress hematopoiesis. Blood. 2016 Nov 10;128(19):2285-2296
Schoedel KB, Morcos MNF, Zerjatke T, Roeder I, Grinenko T, Voehringer D, Göthert JR, Waskow C, Roers A, Gerbaulet A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1182/blood- 2016-03-706010) - A self-sustained loop of inflammation-driven inhibition of beige adipogenesis in obesity. Nat Immunol. 2017 Jun;18(6):654-664
Chung KJ, Chatzigeorgiou A, Economopoulou M, Garcia-Martin R, Alexaki VI, Mitroulis I, Nati M, Gebler J, Ziemssen T, Goelz SE, Phieler J, Lim JH, Karalis KP, Papayannopoulou T, Blüher M, Hajishengallis G, Chavakis T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ni.3728) - Bottom-Up Structuring and Site-Selective Modification of Hydrogels Using a Two-Photon [2+2] Cycloaddition of Maleimide. Adv Mater. 2017 Jan;29(2)
Jungnickel C, Tsurkan MV, Wogan K, Werner C, Schlierf M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/adma.201603327) - Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition. Am Chem Soc. 2017 Mar 22;139(11):4019-4024
Bilkova E, Pleskot R, Rissanen S, Sun S, Czogalla A, Cwiklik L, Róg T, Vattulainen I, Cremer PS, Jungwirth P, Coskun Ü
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/jacs.6b11760) - Changes in microtubule overlap length regulate kinesin-14-driven microtubule sliding. Nat Chem Biol. 2017 Oct 16
Braun M, Lansky Z, Szuba A, Schwarz FW, Mitra A, Gao M, Lüdecke A, Ten Wolde PR, Diez S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nchembio.2495) - Development of a genetic sensor that eliminates p53 deficient cells. Nat Commun. 2017 Nov 13;8(1):1463
Mircetic J, Dietrich A, Paszkowski- Rogacz M, Krause M, Buchholz F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-017- 01688-w) - Different developmental histories of beta-cells generate functional and proliferative heterogeneity during islet growth. Nat Commun. 2017 Sep 22;8(1):664
Singh SP, Janjuha S, Hartmann T, Kayisoglu Ö, Konantz J, Birke S, Murawala P, Alfar EA, Murata K, Eugster A, Tsuji N, Morrissey ER, Brand M, Ninov N
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-017-00461-3) - Dipolar Relaxation Dynamics at the Active Site of an ATPase Regulated by Membrane Lateral Pressure. Angew Chem Int Ed Engl. 2017 Jan 24;56(5):1269-1272
Fischermeier E, Pospíšil P, Sayed A, Hof M, Solioz M, Fahmy K
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201611582) - Dynamic stepwise opening of integron attC DNA hairpins by SSB prevents toxicity and ensures functionality. Nucleic Acids Res. 2017 Oct 13;45(18):10555-10563
Grieb MS, Nivina A, Cheeseman BL, Hartmann A, Mazel D, Schlierf M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkx670) - Forbidden Chemistry: Two-Photon Pathway in [2+2] Cycloaddition of Maleimides. J Am Chem Soc. 2017 Aug 2;139(30):10184-10187
Tsurkan MV, Jungnickel C, Schlierf M, Werner C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/jacs.7b04484) - Glycosaminoglycan-based hydrogels capture inflammatory chemokines and rescue defective wound healing in mice. Sci Transl Med. 2017 Apr 19;9(386). pii: eaai9044
Lohmann N, Schirmer L, Atallah P, Wandel E, Ferrer RA, Werner C, Simon JC, Franz S, Freudenberg U
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/scitranslmed.aai9044) - Highly-Efficient Guiding of Motile Microtubules on Non-Topographical Motor Patterns. Nano Lett. 2017 Sep 13;17(9):5699-5705
Reuther C, Mittasch M, Naganathan SR, Grill SW, Diez S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.7b02606) - Machine learning meets complex networks via coalescent embedding in the hyperbolic space. Nat Commun. 2017 Nov 20;8(1):1615
Muscoloni A, Thomas JM, Ciucci S, Bianconi G, Cannistraci CV
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-017-01825-5) - The contribution of homology arms to nuclease-assisted genome engineering. Nucleic Acids Res. 2017 Jul 27;45(13):8105-8115
Baker O, Tsurkan S, Fu J, Klink B, Rump A, Obst M, Kranz A, Schröck E, Anastassiadis K, Stewart AF
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkx497) - An E2-ubiquitin thioester-driven approach to identify substrates modified with ubiquitin and ubiquitin-like molecules. Nat Commun. 2018 Nov 14;9(1):4776
Bakos G, Yu L, Gak IA, Roumeliotis TI, Liakopoulos D, Choudhary JS, Mansfeld J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-07251-5) - ATR is a multifunctional regulator of male mouse meiosis. Nat Commun. 2018 Jul 5;9(1):2621
Widger A, Mahadevaiah SK, Lange J, ElInati E, Zohren J, Hirota T, Pacheco S, Maldonado-Linares A, Stanzione M, Ojarikre O, Maciulyte V, de Rooij DG, Tóth A, Roig I, Keeney S, Turner JMA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-04850-0) - Author Correction: The axolotl genome and the evolution of key tissue formation regulators. Nature. 2018 Jul;559(7712):E2
Nowoshilow S, Schloissnig S, Fei JF, Dahl A, Pang AWC, Pippel M, Winkler S, Hastie AR, Young G, Roscito JG, Falcon F, Knapp D, Powell S, Cruz A, Cao H, Habermann B, Hiller M, Tanaka EM, Myers EW
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41586-018-0141-z) - Autophagy orchestrates the regulatory program of tumor-associated myeloid-derived suppressor cells. J Clin Invest. 2018 Aug 31;128(9):3840-3852
Alissafi T, Hatzioannou A, Mintzas K, Barouni RM, Banos A, Sormendi S, Polyzos A, Xilouri M, Wielockx B, Gogas H, Verginis P
(Siehe online unter https://doi.org/10.1172/JCI120888) - Blood Sugar Regulation for Cardiovascular Health Promotion and Disease Prevention: JACC Health Promotion Series. Am Coll Cardiol. 2018 Oct 9;72(15):1829-1844
Schwarz PEH, Timpel P, Harst L, Greaves CJ, Ali MK, Lambert J, Weber MB, Almedawar MM, Morawietz H
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jacc.2018.07.081) - Coacervation-Mediated Combinatorial Synthesis of Biomatrices for Stem Cell Culture and Directed Differentiation. Adv Mater. 2018 May;30(22):e1706100
Wieduwild R, Wetzel R, Husman D, Bauer S, El-Sayed I, Duin S, Murawala P, Thomas AK, Wobus M, Bornhäuser M, Zhang Y
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/adma.201706100) - Conditional control of fluorescent protein degradation by an auxin-dependent nanobody. Nat Commun. 2018 Aug 17;9(1):3297
Daniel K, Icha J, Horenburg C, Müller D, Norden C, Mansfeld J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-05855-5) - DHEA inhibits acute microglia-mediated inflammation through activation of the TrkA-Akt1/2-CREB- Jmjd3 pathway. Mol Psychiatry. 2018 Jun;23(6):1410- 1420
Alexaki VI, Fodelianaki G, Neuwirth A, Mund C, Kourgiantaki A, Ieronimaki E, Lyroni K, Troullinaki M, Fujii C, Kanczkowski W, Ziogas A, Peitzsch M, Grossklaus S, Sönnichsen B, Gravanis A, Bornstein SR, Charalampopoulos I, Tsatsanis C, Chavakis T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/mp.2017.167) - Diffusive tail anchorage determines velocity and force produced by kinesin-14 between crosslinked microtubules. Nat Commun. 2018 Jun 7;9(1):2214
Lüdecke A, Seidel AM, Braun M, Lansky Z, Diez S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-04656-0) - DNA-Mold Templated Assembly of Conductive Gold Nanowires. Nano Lett. 2018 Mar 14;18(3):2116-2123
Bayrak T, Helmi S, Ye J, Kauert D, Kelling J, Schönherr T, Weichelt R, Erbe A, Seidel R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.8b00344) - In situ-forming, cell-instructive hydrogels based on glycosaminoglycans with varied sulfation patterns.. Biomaterials. 2018 Oct;181:227-239
Atallah P, Schirmer L, Tsurkan M, Putra Limasale YD, Zimmermann R, Werner C, Freudenberg U
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.biomaterials.2018.07.056) - Label-Free Detection of Microvesicles and Proteins by the Bundling of Gliding Microtubules. Nano Lett. 2018 Jan 10;18(1):117-123
Chaudhuri S, Korten T, Korten S, Milani G, Lana T, Te Kronnie G, Diez S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.7b03619) - Modulation of Myelopoiesis Progenitors Is an Integral Component of Trained Immunity. Cell. 2018 Jan 11;172(1-2):147-161.e12
Mitroulis I, Ruppova K, Wang B, Chen LS, Grzybek M, Grinenko T, Eugster A, Troullinaki M, Palladini A, Kourtzelis I, Chatzigeorgiou A, Schlitzer A, Beyer M, Joosten LAB, Isermann B, Lesche M, Petzold A, Simons K, Henry I, Dahl A, Schultze JL, Wielockx B, Zamboni N, Mirtschink P, Coskun Ü, Hajishengallis G, Netea MG, Chavakis T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.11.034) - Pharmacophore Nanoarrays on DNA Origami Substrates as a Single-Molecule Assay for Fragment- Based Drug Discovery. Angew Chem Int Ed Engl. 2018 Nov 5;57(45):14873-14877
Kielar C, Reddavide FV, Tubbenhauer S, Cui M, Xu X, Grundmeier G, Zhang Y, Keller A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201806778) - Real-Time Deformability Cytometry: Label-Free Functional Characterization of Cells. Methods Mol Biol. 2018;1678:347-369
Herbig M, Kräter M, Plak K, Müller P, Guck J, Otto O
(Siehe online unter https://doi.org/10.1007/978-1-4939- 7346-0_15) - Reprint of: Blood Sugar Regulation for Cardiovascular Health Promotion and Disease Prevention: JACC Health Promotion Series. Am Coll Cardiol. 2018 Dec 11;72(23 Pt B):3071-3086
Schwarz PEH, Timpel P, Harst L, Greaves CJ, Ali MK, Lambert J, Weber MB, Almedawar MM, Morawietz H
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jacc.2018.10.026) - Rolling circle amplification shows a sinusoidal template length-dependent amplification bias. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 25;46(2):538-545
Joffroy B, Uca YO, Prešern D, Doye JPK, Schmidt TL
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkx1238) - Simultaneous lineage tracing and cell-type identification using CRISPR-Cas9-induced genetic scars. Nat Biotechnol. 2018 Jun;36(5):469-473
Spanjaard B, Hu B, Mitic N, Olivares-Chauvet P, Janjuha S, Ninov N, Junker JP
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nbt.4124) - Structural Transformation of Wireframe DNA Origami via DNA Polymerase Assisted Gap-Filling. ACS Nano. 2018 Mar 27;12(3):2546-2553
Agarwal NP, Matthies M, Joffroy B, Schmidt TL
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acsnano.7b08345) - Structural Transformation of Wireframe DNA Origami via DNA Polymerase Assisted Gap-Filling. ACS Nano. 2018 Mar 27;12(3):2546-2553
Agarwal NP, Matthies M, Joffroy B, Schmidt TL
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acsnano.7b08345) - A heterodimer of evolved designer-recombinases precisely excises a human genomic DNA locus. Nucleic Acids Res. 2019 Nov 20. pii: gkz1078
Lansing F, Paszkowski-Rogacz M, Schmitt LT, Martin Schneider P, Romanos TR, Sonntag J, Buchholz F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkz1078) - Degron-tagged reporters probe membrane topology and enable the specific labelling of membranewrapped structures. AM. Nat Commun. 2019 Aug 2;10(1):3490
Beer KB, Fazeli G, Judasova K, Irmisch L, Causemann J, Mansfeld J, Wehman AM
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-019-11442-z) - FUS pathology in ALS is linked to alterations in multiple ALS-associated proteins and rescued by drugs stimulating autophagy. Acta Neuropathol. 2019 Jul;138(1):67-84
Marrone L, Drexler HCA, Wang J, Tripathi P, Distler T, Heisterkamp P, Anderson EN, Kour S, Moraiti A, Maharana S, Bhatnagar R, Belgard TG, Tripathy V, Kalmbach N, Hosseinzadeh Z, Crippa V, Abo-Rady M, Wegner F, Poletti A, Troost D, Aronica E, Busskamp V, Weis J, Pandey UB, Hyman AA, Alberti S, Goswami A, Sterneckert J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00401-019-01998-x) - Glia-neuron interactions underlie state transitions to generalized seizures. Nat Commun. 2019 Aug 23;10(1):3830
Diaz Verdugo C, Myren- Svelstad S, Aydin E, Van Hoeymissen E, Deneubourg C, Vanderhaeghe S, Vancraeynest J, Pelgrims R, Cosacak MI, Muto A, Kizil C, Kawakami K, Jurisch-Yaksi N, Yaksi E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-019-11739-z) - Mouse ANKRD31 Regulates Spatiotemporal Patterning of Meiotic Recombination Initiation and Ensures Recombination between X and Y Sex Chromosomes. Mol Cell. 2019 Jun 6;74(5):1069-1085.e11
Papanikos F, Clément JAJ, Testa E, Ravindranathan R, Grey C, Dereli I, Bondarieva A, Valerio-Cabrera S, Stanzione M, Schleiffer A, Jansa P, Lustyk D, Fei JF, Adams IR, Forejt J, Barchi M, de Massy B, Toth A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.03.022) - Structural heterogeneity of attC integron recombination sites revealed by optical tweezers. Nucleic Acids Res. 2019 Feb 28;47(4):1861-1870
Mukhortava A, Pöge M, Grieb MS, Nivina A, Loot C, Mazel D, Schlierf M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gky1258) - Transplantation of photoreceptors into the degenerative retina: Current state and future perspectives. Prog Retin Eye Res. 2019 Mar;69:1-37. Epub 2018 Nov 13. Review.
Gasparini SJ, Llonch S, Borsch O, Ader M.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.preteyeres.2018.11.001)