Massenspektrometer

• Subject Area: Basic Research in Biology and Medicine
• Term: Funded in 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 240891705

Die DNA Methylierung (5’Methylcytosin (5mC)) ist eine wichtige epigenetische Modifikation von DNA und spielt in der Genregulation eine bedeutende Rolle. Die Arbeitsgruppe Christof Niehrs, aber auch George Reid, beschäftigt sich speziell mit der DNA Demethylierung, einem weit verbreiteten Phänomen bei Pflanzen und Tieren. Ein zentraler Mechanismus bei der DNA Demethylierung ist die jüngst entdeckte Oxidation von 5mC zu verschiedenen Produkten und deren anschließende Entfernung aus der DNA. Für die Untersuchung der Mechanismen der DNA Demethylierung ist die Detektion und Quantifizierung oxidierter 5mC Derivate essentiell. Der Goldstandard zur Messung der äußerst geringen Mengen oxidierter 5mC Derivate ist die Analyse hydrolysierter DNA mittels Massenspektrometrie (genauer: tandem Quadrupol LC-MS/MS). Zur mechanistischen Analyse der DNA Demethylierung ist ein hochempfindliches Massenspektrometer daher unabdingbar und wird hier zur Bezuschussung beantragt.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: Massenspektrometer
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Leader: Professor Christof Niehrs, Ph.D.