Analysis of Information Processing in Molecular Networks Using the Communication Theory of Discrete Processes

• Applicant: Professor Dr.-Ing. Steffen Schober
• Subject Area: Electronic Semiconductors, Components and Circuits, Integrated Systems, Sensor Technology, Theoretical Electrical Engineering
• Term: from 2013 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 240733145

• Final Report Year: 2018

Final Report Abstract

In Abweichung der ursprünglichen Projektziele begann das Projekt mit der Untersuchung von Methoden zur Verbesserung von Messmethden (next-generation-sequencing) zur Messung von mRNAs und DNAs. Das Hauptergebniss ist die Konstruktion so genannter Barcodes basierend auf watermark codes sowie deren Dekodierung. Der Einsatz solcher Barcodes kann zur verbesserten Ausnutzung der Kapazität moderner Sequenziermaschinen genutzt werden.

Publications

• Insertion and deletion correcting DNA barcodes based on watermarks. BMC Bioinformatics. 2015 Feb 18;16:50
  David Kracht, Steffen Schober
  (See online at https://doi.org/10.1186/s12859-015-0482-7)