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The potassium-sensory mechanism of a prokaryotic histidine kinase/response regulator system

Subject Area Metabolism, Biochemistry and Genetics of Microorganisms
Term from 2013 to 2018
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 236776139
 
Final Report Year 2017

Final Report Abstract

Um unter ständig variierenden Umweltbedingungen zu überleben, besitzen Bakterien sogenannte Zwei-Komponentensysteme. Diese Systeme, die aus einer Histidinkinase und einem Antwortregulator bestehen, sensieren Umweltreize, übertragen Informationen mittels Phosphorylierung und induzieren eine zelluläre Antwort. Escherichia coli beispielsweise besitzt 30 dieser Systeme. Das K+-Limitation sensierende KdpD/KdpE-System ist in mehr als 1000 sequenzierten Bacteria- und Archaea-Genomen kodiert, wozu viele pathogene Bakterien gehören. Im Rahmen des Projektes ist es gelungen, KdpD als einen dualen Sensor zu identifizieren, der einerseits intrazellulär den Bedarf von E. coli nach K+ und anderseits die extrazelluläre Verfügbarkeit von K+ sensiert. Begleitende theoretische Simulationen unterstreichen, dass dieses Regulationsregime, das wahrscheinlich weiter verbreitet ist als bisher angenommen, eine maximale Homöostase für essentielle Nährstoffe ermöglicht. Die duale Sensorik von KdpD scheint mit einer großen strukturellen Dynamik herzugehen, die alle bisherigen Versuche zur Strukturaufklärung des Rezeptors beeinträchtigt. Mit den Arbeiten zum Projekt wurden darüber hinaus neue Einblicke in die Feinregulation des K+-abhängigen Regulationsnetzwerkes von Bakterien gewonnen sowie neue Genprodukte, die potentiell einer K+-abhängigen Regulation unterliegen, aufgedeckt.

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