Genomics and cell biology of highly polyploidic, giant sulfur bacteria

• Applicant: Verena Carvalho, Ph.D.
• Subject Area: Metabolism, Biochemistry and Genetics of Microorganisms ; Evolutionary Cell and Developmental Biology (Zoology)
• Term: from 2012 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 226167356

• Final Report Year: 2015

Final Report Abstract

Ich habe während der Förderzeit umfassende Ergebnisse über die morphologische und phylogenetische Diversität der großen Schwefelbakterien zusammengetragen und in "Antonie van Leeuwenhoek" und "The ISME Journal" veröffentlicht. Dabei ging es hauptsächlich um die vielseitigen Organismen der Familie Beggiatoaceae und um die Kalzit-speichernden Achromatiaceae. Zusammen mit Professor Teske habe ich außerdem die aktuellen Kenntnisse in der Familie Beggiatoaceae und Leucotrichaceae in zwei Buchkapiteln für "The Prokaryotes" festgehalten. Das Teilprojekt über die Genomkonservierung von klonalen Zellen in einem Filament oder einer Kette hat bereits teilweise gute Daten geliefert, die momentan ausgewertet werden. Die Realisierung der subzellulären Untersuchung von einzelnen Thiomargarita Zellen hat sich als schwierig herausgestellt und hat bisher nicht die erhofften Daten geliefert. Für andere Aspekte des beantragten Projekts standen nicht genug Finanzmittel zur Verfügung wie ursprünglich geplant und konnten daher nicht durchgeführt werden. Jedoch habe ich unverhofft eine neue Population von Achromatium Zellen entdeckt und war erfolgreich in deren Genomsequenzierung. Da dies die ersten Daten für diese Familie darstellt, findet dieses Projekt bereits guten wissenschaftlichen Anklang.

Publications

• (2013) Phylogenetic and morphologic complexity in giant sulphur bacteria. Antonie van Leeuwenhoek 104, 169-186
  Salman V, Bailey JV, Teske A
  
• (2014) The Beggiatoaceae. In: The Prokaryotes. Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E, Thompson F (eds) Springer Berlin Heidelberg, pp 93-134
  Teske A, Salman V
  
• (2014) The Leucotrichaceae. In: The Prokaryotes. Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E, Thompson F (eds) Springer Berlin Heidelberg, pp 391-409
  Teske A, Salman V
  
• (2015) Calcite-accumulating large sulfur bacteria of the genus Achromatium in Sippewissett Salt Marsh. The ISME Journal
  Salman V, Yang T, Berben T, Klein F, Angert E, Teske A
  (See online at https://doi.org/10.1038/ismej.2015.62)