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Automatisiertes Weitfeld-Fluoreszenzmikroskopsystem

Subject Area Basic Research in Biology and Medicine
Term Funded in 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 215423068
 
Final Report Year 2016

Final Report Abstract

Die Faltung neusynthetisierter Polypeptidketten in ihre native und funktionelle Konformation stellt einen komplexen und anfälligen Prozess dar. Fehler in Transkriptions- und Translationsprozessen, sowie externe und interne Streßbedingungen können zu einer erhöhten Proteinmißfaltung und nachfolgend Proteinaggregation führen. Im Fokus der Anwendungen des Fluoreszenzmikroskops stand die Verfolgung des Aggregationsprozesses in Zellen (1) sowie die Auflösung von Proteinaggregaten durch molekulare Chaperone in den Modellorganismen Escherichia coli und Saccharomyces cerevisiae (2). (1) Es konnte gezeigt werden, dass sich abhängig von applizierten Streßbedingungen unterschiedliche Proteinablagerungen in Zellen ausbilden. Abhängig vom Modellorganismus werden die Proteinaggreate an unterschiedlichen, jedoch spezifischen zellulären Stellen abgelagert. Diese Ablagerung erlaubt eine asymmetrische Verteilung der mißgefalteten Proteine nach Zellteilung und die Bildung von Tochterzellen ohne Proteinaggregate. Dies stellt einen zellulären Verjüngungsprozess dar. Die Ausbildung von Proteinaggregaten in Hefezellen ist durch zelluläre Faktoren kontrolliert. Wir konnten zeigen, dass Kompartiment-spezifische Aggregasen die Bildung von Proteinaggregaten im Zytosol (Hsp42) und Zellkern (Btn2) steuern. Im Kern kontrolliert Btn2 ebenfalls die Ausbildung spezifischer Proteinablagerungen unter DNA- Stress, welche evtl. regulatorische Funktion besitzen. Zur Verfolgung der Proteinablagerungen wurden fluoreszierende Modellproteine in den Modellorganismen exprimiert und deren zelluläre Lokalisation unter Verwendung des Fluoreszenzmikroskops bestimmt. Das Hitzeschockmodul erlaubte es, die Ausbildung und Auflösung von Proteinaggregaten in einzelnen Zellen zeitaufgelöst zu verfolgen. (2) Kooperierende Hsp70 und Hsp100 Chaperone reaktivieren aggregierte Proteine. Diese Aktvität ist entscheidend für das Überleben von Zellen bei extremen Stressbedingungen. Wir konnten unter Verwendung von fluoreszierenden Chaperonvarianten und dem Fluoreszenzmikroskop eine Hierarchie der Chaperonaktivitäten an Proteinaggregaten und Prionenfibrillen bestimmen. Hsp70 Bindung an Aggregate und Prionen bewirkt die Rekrutierung und Aktivierung kooperierender Hsp100 Chaperone. Dies stellt den konservierten Mechanismus der Auflösung von Proteinaggregaten dar.

Publications

  • Hsp70 proteins bind Hsp100 regulatory M domains to activate AAA+ disaggregase at aggregate surfaces. Nat Struct Mol Biol. 2012, 19:1347-1355
    Seyffer, F., E. Kummer, Y. Oguchi, J. Winkler, M. Kumar, R. Zahn, V. Sourjik, B. Bukau, and A. Mogk
    (See online at https://doi.org/10.1038/nsmb.2442)
  • Hsp70 targets Hsp100 chaperones to substrates for protein disaggregation and prion fragmentation. J Cell Biol. 2012, 198:387-404
    Winkler, J., J. Tyedmers, B. Bukau, and A. Mogk
    (See online at https://doi.org/10.1083/jcb.201201074)
  • ClpV recycles VipA/VipB tubules and prevents non-productive tubule formation to ensure efficient type VI protein secretion. Mol Microbiol. 2013, 87:1013-1028
    Kapitein, N., Bönemann, G., Pietrosiuk, A., Seyffer, F., Hausser, I. Locker, J.K., Mogk, A.
    (See online at https://doi.org/10.1111/mmi.12147)
  • Coordination of translational control and protein homeostasis during severe heat stress. Curr Biol. 2013, 23:2452-2462
    Cherkasov, V., S. Hofmann, S. Druffel- Augustin, A. Mogk, J. Tyedmers, G. Stoecklin, and B. Bukau
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.cub.2013.09.058)
  • Mechanism of Hsp104/ClpB inhibition by prion curing Guanidinium hydrochloride. FEBS Lett. 2013, 587:810-817
    Kummer, E., Y. Oguchi, F. Seyffer, B. Bukau, and A. Mogk
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.febslet.2013.02.011)
  • Compartment-specific aggregases direct distinct nuclear and cytoplasmic aggregate deposition. EMBO J. 2015, 34:778-797
    Miller, S.B., C.T. Ho, J. Winkler, M. Khokhrina, A. Neuner, M.Y. Mohamed, D.L. Guilbride, K. Richter, M. Lisby, E. Schiebel, A. Mogk, and B. Bukau
    (See online at https://doi.org/10.15252/embj.201489524)
  • Prolonged starvation drives reversible sequestration of lipid biosynthetic enzymes and organelle reorganization in Saccharomyces cerevisiae. Mol Biol Cell. 2015, 26:1601-1615
    Suresh, H.G., A.X. da Silveira Dos Santos, W. Kukulski, J. Tyedmers, H. Riezman, B. Bukau, and A. Mogk
    (See online at https://doi.org/10.1091/mbc.E14-11-1559)
 
 

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