Storage-System für Daten aus Hochdurchsatzexperimenten

• Subject Area: Basic Research in Biology and Medicine
• Term: Funded in 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 212933541

Das Genom ist die Gesamtheit der Erbinformation eines Lebewesens, die in der DNA codiert ist. Steuerinformationen, sogenannte epigenetische Modifikationen, bestimmen, wie die Information des Genoms verarbeitet wird. Die epigenetische Landschaft ist durch das Zusammenspiel verschiedener Einflüsse wie DNA Methylierung, Histon Modifikation und nucleosomale Position charakterisiert. Mit dem hier beantragten Gerät wird die Grundlage zur zentralen Archivierung der biologischen Datensätze und aller Analyse geschaffen. Weiterhin soll den Kooperationspartnern ein Zugriff auf die Daten ermöglicht werden. Die direkte Anbindung der großen Datenmenge zu den Computern, die die Analy-setools ausführen, ist von großer Bedeutung. Ziel ist es, genomweite nucleosomale Positionenkarten mit den zugehörigen Korrelationen zu DNA Methylierung und Histon-Modifikationen zu erstellen. Diese Positionen sollen zusätzlich der Simulation von Nucleosomenketten dienen, wobei die Modellierung der räumlichen Struktur im Hinblick auf die Diagnose von Krankheiten und der Entwicklung neuer Me-dikamente zukunftsweisend ist.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Instrumentation Group: 7000 Datenverarbeitungsanlagen, zentrale Rechenanlagen
• Applicant Institution: Hochschule Stralsund
• Leader: Professor Dr. Gero Wedemann