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Nanoreaktionsplattform zur Hochdurchsatzgenanalyse

Subject Area Medicine
Term Funded in 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 204078283
 
Final Report Year 2015

Final Report Abstract

Die Plattform wurde im Berichtszeitraum hauptsächlich für drei Anwendungsbereiche genutzt: (1) Hochdurchsatz-Genotypisierung; (2) Hochparallele Multiplex-PCR zur Next- Generation-Sequenzierung; (3) Hochparallele Genexpressionsanalyse. In den ersten drei Jahren wurde das Gerät von sechs Instituten an der Medizinischen Hochschule Hannover frequentiert. Damit wurden Forschungsprojekte der Frauenklinik, Strahlentherapie, Rechtsmedizin, Urologie, Immunologie und Gastroenterologie unterstützt. Die meisten Analysen wurden im Bereich der Genotypisierung mit SNPtype oder TaqMan Assays auf der Plattform durchgeführt (> 500.000 Einzelanalysen). Das Gerät ermöglichte umfangreiche Fall-Kontroll-Studien zum Mammakarzinom, Zervixkarzinom, Prostatakarzinom und plötzlichem Kindstod. Die zweithäufigste Anwendung der Gerätschaft war die hochparallele Generierung von Amplicons für das Next-Generation-Sequencing mittels Arrays. Dies ermöglichte umfangreiche Sequenzierungen von Kandidatengenen sowie Validierungsstudien nach Exomsequenzierungen. Als dritte Anwendung kamen Genexpressionsanalysen mittels Real-time PCR auf der Plattform vor allem bei der Untersuchung muriner Gewebe in neurologischen, immunologischen und gastroenterologischen Forschungsprojekten zum Einsatz. Mehrere Publikationen mit Nutzung der Technologie sind bereits veröffentlicht, doch die meisten Ergebnisse, die mit der Plattform bisher erzielt wurden, sind Bestandteil von noch laufenden längerfristigen Projekten.

Publications

 
 

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