venia legendi: Tierzucht und Haustiergenetik
Final Report Abstract
Das Heisenbergstipendium gliederte sich zeitlich in zwei Phasen, welche vom Stipendiaten am Institut für Tierzucht und Tierhaltung der Universität Kiel (Phase 1) sowie an der norwegischen Universität für Lebenswissenschaften in Aas (Phase 2) verbracht wurden. In der ersten Phase wurden bereits begonnene Forschungsvorhaben zum Abschluss gebracht, neue initiiert und in Verbundprojekten beantragt. In der zweiten Phase wurden zusammen mit Prof. T. Meuwissen zunächst weitere Arbeiten zur genetischen Diversität landwirtschaftlich genutzter Spezies durchgeführt und publiziert. Anschließend wurden zwei Arbeiten zur genomischen Selektion angefertigt und publiziert. In der ersten Arbeit wurde eine nicht-parametrische Methode zur Schätzung massiver Markereffekte auf ein quantitatives Merkmal weiterentwickelt und mittels stochastischer Simulationen mit zwei parametrischen Methoden (BLUP und BayesB) verglichen. Es zeigte sich, dass die nicht-parametrischen Verfahren dem BayesB unterlegen sind. Dies bedeutet, dass der Einsatz der nicht-parametrischen Verfahren nur dann sinnvoll ist, wenn wenige Informationen zur Bildung geeigneter Priors vorliegen. In der zweiten Arbeit wurde die Verteilung von additiven und dominanten QTL-Effekten abgeleitet. Dazu wurden bereits publizierte QTL-Effekte aufbereitet und deren Verteilung mit gemischten Normalverteilungen modelliert. Die additiven Effekte zeigten zwei Komponenten innerhalb der gemischten Normalverteilung, die Dominanzkoeffizienten nur eine. Die Verteilung der additiven Effekte wurde zusätzlich mit einer abgeschnittenen Exponentialverteilung modelliert. Die Ergebnisse dieser Arbeit können bei der Planung von Experimenten zur genomischen Selektion genutzt werden. Bestandteil der zweiten Phase des Projektes war auch eine Vorbereitung auf die Übernahme der Tierzuchtprofessur an der Universität Hohenheim. Mit der Übernahme dieser Professur wurde das Stipendium vorzeitig beendet.
Publications
- Analyse von Auktionsdaten der Pferdezucht und Einflussfaktoren auf die Preisbildung. Züchtungskunde, Bd. 79. 2007, H. 2, S. 111 – 118.
Icken W., Bennewitz J., Kalm E.
- Analysis of genetic diversity and conservation priorities for six north Ethiopian cattle breeds. Journal of Animal Breeding and Genetics, Vol.ume 124. 2007, Issue 4, pp. 236–241.
Zerabruk M., Bennewitz J., Kantanen J., Olsaker I., Vangen O.
(See online at https://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2007.00660.x) - Exclusion of NFYB as candidate gene for congenital splay leg in piglets and radiation hybrid mapping of further five homologous porcine genes from human chromosome 12 (HSA12). Cytogenetics and Genome Research, Vol. 118. 2007, Issue 1, pp. 67-71.
Böttcher D., Paul S., Bennewitz J., Swalve H.H., Thaller G., Maak S.
(See online at https://dx.doi.org/10.1159/000106443) - Genetic parameters for serial, automatically recorded milkability and its relationship to udder health in dairy cattle. Animal, Vol. 1. 2007, Issue 06, pp. 787-796.
Gäde S., Stamer E., Bennewitz J., Junge W., Kalm E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1017/S1751731107000092) - Measuring genetic diversity in livestock. In: K. Oldenbroek (Ed.) Utilization and management of farm animal genetic resources. Wageningen Academic Publishers, The Netherlands.
Eding H., Bennewitz J.
(See online at https://dx.doi.org/10.3920/978-90-8686-592-5) - Selection of breeds for conservation. In: K. Oldenbroek (Ed.) Utilization and management of farm animal genetic resources. Wageningen Academic Publishers, The Netherlands.
Bennewitz J., Eding H., Ruane J., Simianer H.
(See online at https://dx.doi.org/10.3920/978-90-8686-592-5) - Variance Component and Breeding Value Estimation for Reproductive Traits in Laying Hens Using a Bayesian Threshold Model. Poultry Science, Vol. 86. 2007, Issue 5, pp. 823-828.
Bennewitz J., Morgades O., Preisinger P., Thaller G., Kalm E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1093/ps/86.5.823) - A note on genetic parameters for estrus behaviour in sows. Applied Animal Behaviour Science, Vol. 109. 2008, Issues 2–4, pp. 406–409.
Gäde S., Bennewitz J., Kirchner K., Looft H., Knap P.W., Thaller G., Kalm E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1016/j.applanim.2007.04.004) - Genetic aspects regarding piglet losses and the maternal behaviour of sows. Part 1. Genetic analysis of piglet mortality and fertility traits in pigs. Animal, Vol. 2. 2008, Issue 9, pp. 1273-1280.
Hellbrügge B. Tölle K.-H., Bennewitz J., Henze C., Presuhn U., Krieter J.,
(See online at https://dx.doi.org/10.1017/S1751731108002504) - Genetic aspects regarding piglet losses and the maternal behaviour of sows. Part 2. Genetic relationship between maternal behaviour in sows and piglet mortality. Animal, Vol. 2. 2008, Issue 9, pp. 1281-1288.
Hellbrügge B. Tölle K.-H., Bennewitz J., Henze C., Presuhn U., Krieter J.
(See online at https://dx.doi.org/10.1017/S1751731108002516) - Genetic parameters for maternal behaviour traits in sows. Livestock Science, Vol. 114. 2008, Issue 1, pp. 31–41.
Gäde S., Bennewitz J., Kirchner K., Looft H., Knap P.W., Thaller G., Kalm E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1016/j.livsci.2007.04.006) - Investigations on merging breeds in genetic conservation schemes. Journal of Dairy Science, Vol. 91. 2008, Issue 6, pp. 2512–2519.
Bennewitz J., Simianer H., Meuwissen T. H. E.
(See online at https://dx.doi.org/10.3168/jds.2007-0924) - Simulationen über die Konsequenzen der genomischen Selektion in einem Rinderzuchtprogramm. Züchtungskunde, Vol. 80. 2008, H. 6, S. 443 – 451.
Himrichs D., Bennewitz J., Tetens J., Thaller G.
- Genomic breeding value estimation using nonparametric regression and additive models. Genetics Selection Evolution 41: 20.
Bennewitz J., Solberg T.R., Meuwissen T.H.E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1186/1297-9686-41-20) - Refined mapping of a QTL for somatic cell score on BTA27 in the German Holstein using combined linkage and linkage disequilibrium analysis. Canadian Journal of Animal Science, Vol. 90. 2010, Issue 2, pp. 169-178.
Baes C., Mayer M., Tetens J., Bennewitz J., Liu Z., Reinhardt F., Thaller G., Reinsch, N.
(See online at https://dx.doi.org/10.4141/CJAS09069) - Confirming QTL for calving and fertility traits on bovine chromosome 7 and 10 in German Holsteins. Livestock science, Vol. 129. 2010, no. 1-3, pp. 237-240.
Seidenspinner T., Bennewitz J., Reinhardt F., Thaller G.
- The distribution of QTL additive and dominance effects in porcine F2 crosses. Journal of Animal Breeding and Genetics, Vol. 127. 2010, Issue 3, pp. 171–179.
Bennewitz J., Meuwissen T. H. E.
(See online at https://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2009.00847.x) - The need for sharp phenotypes in QTL mapping for calving traits in dairy cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, Vol. 126. 2009, Issue 6, pp.455–462.
Seidenspinner T., Bennewitz J., Reinhardt F., Thaller G.
(See online at https://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0388.2009.00804.x)
