Origin of deep-biosphere bacteria in sediments of the Black Sea and the Namibian Upwelling Area
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die vier zu untersuchenden Modellorganismen konnten spezifisch in Sedimentproben der verschiedenen Standorte nachgewiesen und quantifiziert werden. Wie ursprünglich erwartet, war die Chloroflexus Gruppe in fast allen Sedimentschichten des Schwarzen Meeres vorhanden und könnte sogar aus dem Eem Sapropel angereichert werden. Mit Ausnahme von Photobacterium sp. wurden Vertreter der anderen Modellorganismen ebenfalls im Sapropel detektiert. Photobacterium sp. wurde ausschließlich in oberflächennahen Sedimenten des Schwarzen Meeres gefunden. R. radiobacter wurde überwiegend am Standort 20 bis zu einer Sedimenttiefe von 2 mbsf nachgewiesen. In Sedimenten des namibischen Auftriebsgebietes, nahm der prozentuale Anteil dieser Art von ~ 0,1% aller Bakterien an der Sedimentoberfläche bis auf ~ 24% in 5,4 mbsf mit der Tiefe stetig zu. Damit haben wir unsere ursprüngliche Annahme bestätigt, dass sich Populationen von typischen Bakterien der Tiefen Biosphäre erst innerhalb tieferer Sedimentschichten entwickeln. Trotz der großen Anzahl an phylogenetisch diversen Isolaten, die wir in unserem Kultivierungsansatz erhalten haben, konnten unsere Modellorganismen noch nicht als Reinkulturen isoliert werden. Als zusätzliches Ergebnis konnten wir aber den häufigsten Sulfatreduzierer in Sedimenten des namibischen Auftriebsgebietes quantifizieren und metabolisch charakterisieren.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- (2008) Tracing the migration of bacteria from the water column into deep sediment layers. BioSpektrum Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2008:151, ISSN 0947-0867
Frerichs J, Engelen B, Cypionka, H
- (2009) Cultivation of sulfate-reducing bacteria from marine sediments of the coastal upwelling area off Namibia. BioSpektrum Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2009:51, p. 132, ISSN 0947-0867
Kraft B, Engelen B, Cypionka H, Könneke M
- (2011) Distribution of deepbiosphere bacteria in sediments and the water column of the Black Sea. BioSpektrum Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2011, p. 109, ISSN 0947-0867
Straaten N, Wichmann H, Sahlberg M, Cypionka H, Engelen B
- (2011) Tracing the Migration of Bacteria from the Water Column into Subsurface Sediments. In: Seifert R, Boetius A, Bohrmann G, Bialas J, Borowski C (Eds.), Biogeochemistry, Microbiology, Marine Fluids, Gas Hydrates and Regional Palaeo-Climate of the Black Sea, Cruise No. 72, February 7 - June 4, 2007, METEOR-Berichte, Universität Hamburg, 5-25 - 5-28, ISSN 0936-8957
Cypionka H, Engelen B
- (2012) Desulfofrigus spec. prevails in sulfate-reducing dilution cultures from sediments of the Benguela upwelling area. FEMS Microbiol Ecol 84:86–97
Kraft B, Engelen B, Goldhammer T, Lin Y-S, Cypionka H, Könneke M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1111/1574-6941.12039) - (2012) Microbiology: Molecular-guided cultivation assays, distribution and quantification of microbial communities, community zonation, activity, and genomics based on molecular methods. In: Zabel M, Boetius A, Emeis K-C, Ferdelman TG, Spieß V (Eds.), PROSA: Process Studies in the Eastern South Atlantic, Cruise No. 76, April 12 – August 24, 2008, METEOR-Berichte, Universität Hamburg, 1-33 - 1-40, ISSN 2195-8475
Engelen B, Kleindienst S, Lever M, Siegert M
