Evolutionary and functional analysis of cis-regulatory sequences (A11)

• Subject Area: Bioinformatics and Theoretical Biology
• Term: from 2009 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5486242

Unser Fernziel ist die Rekonstruktion des Genregulationsnetzwerkes der Hefe durch genomweiteAnalyse der Transkriptionsfaktorbindestellen und Integration mit Genexpressionsdaten.Wir werden quantitative statistische Modelle der Transkriptionsregulation durch den Mediatorentwickeln und das Problem der Parameterschätzung mit neuartigen Bayes’schen Sampling-Methoden angehen, die es erlauben, Kombinationen von Millionen stark korrelierter Parametereffektiv abzusuchen. Wir möchten die Netzwerkanalyse mit der Promotoranalyse kombinieren,indem wir die transkriptionelle Antwort der cis-regulatorischen Module modellieren.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 646: Networks in Genome Expression and Maintenance
• Applicant Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Project Head: Dr. Johannes Söding, until 12/2015